الهيكل الأساسي هو تسلسل الأحماض الأمينية التي تشكل سلسلة بولي ببتيد الكولاجين ؛ يتكون جزيء الكولاجين من 3 حلزونات أعسر (بنية ثانوية) من سلاسل البولي ببتيد ، والتي تتشابك لتشكيل حلزون أيمن (هيكل ثلاثي) حول المحور الجزيئي المركزي ؛ يبلغ طول جزيئات الكولاجين السليمة حوالي 28 0 نانومتر وقطرها 1.5 نانومتر ؛ في التركيب ثنائي الأبعاد لليفات الكولاجين من النوع الأول (أنماط حيود الأشعة السينية ذات الزاوية الصغيرة والميكروغرافيا الإلكترونية للإرسال) ، تمر جزيئات الكولاجين بمسافة أو أكثر 4D متداخلة مع جزيء كولاجين آخر ، تمثل D مسافة التكرار الأساسية التي تُرى في الصورة الصغيرة نمط حيود زاوية الأشعة السينية ، أو مسافة التكرار المرئية في صورة مجهرية الإلكترون. نظرًا لأن طول جزيئات الكولاجين يبلغ حوالي 4.4D ، فإن تشذير جزيئات الكولاجين ينتج عنه منطقة مطوية تبلغ حوالي 0 .4D ومنطقة عيب تبلغ حوالي 0.6D.
