تشمل طرق التنقية التي يمكن استخدامها للكولاجين التمليح ، والغسيل الكلوي ، والطرد المركزي ، والرحلان الكهربي ، والكروماتوغرافيا ، والتي من أكثرها استخدامًا التمليح ، والطرد المركزي ، والرحلان الكهربي. نظرًا لأنه من الصعب فصل الكولاجين تمامًا وتنقيته بطريقة واحدة ، فإن العملية الفعلية هي تحقيق الغرض من فصل وتنقية الكولاجين بطريقة مركبة. تستخدم طريقة التمليح عمومًا تركيز عالٍ من كلوريد الصوديوم ؛ عادة ما تستخدم طريقة الطرد المركزي جهاز طرد مركزي فائق درجة الحرارة المنخفضة ؛ تستخدم طريقة الرحلان الكهربي في الغالب الرحلان الكهربائي لهلام دوديسيل كبريتات بولي أكريلاميد (SDS-PAGE) ، والذي يمكن استخدامه لكلا الكولاجين. يمكن استخدامه أيضًا لتحديد الكتلة الجزيئية النسبية لجزيئات الكولاجين. على سبيل المثال ، يستخدم بعض الأشخاص طريقة من ثلاث خطوات للتكسير وتحلل الإنزيم والتمليح لتنقية الكولاجين من النوع الأول من عظام الغنم Sunite. تمت إزالة المواد غير الكولاجينية في العظام أولاً ، ثم تمت إضافة 1 0 بالمائة من البيبسين إلى الحبيبات ، وهضمها عند 4 درجات لمدة 24 ساعة ، وطردها عند 14 ، 000 دورة / دقيقة لـ 40 دقيقة. تخلص من الراسب وأضف كلوريد الصوديوم إلى المادة الطافية لجعل التركيز النهائي يصل إلى 0.9 مليلتر / لتر ، اتركه يقف طوال الليل ، ثم الطرد المركزي. الراسب النهائي هو النوع الأول من الكولاجين.
